Baudouin Jurdant foi professor na Universidade de Paris Diderot entre 1997 e 2011, depois de ter sido professor na Universidade de Estrasburgo, onde dirigiu de 1976 a 1997 o Groupe d’Etude et de Recherche sur la Science de l’Université Louis Pasteur (GERSULP), fundado em 1973 por Guy Ourisson, então reitor da universidade.

Baudouin Jurdant iniciou a sua carreira profissional como jornalista num grande jornal diário regional em 1962. Em 1973, obteve o seu doutoramento (Les Problèmes théoriques de la vulgarisation scientifique, publicado em 2009 pelas Editions des Archives contemporaines). Em outubro de 1969, foi nomeado Teaching and Research Fellow na Universidade de York, na Grã-Bretanha, no Departamento de Línguas, e participou num inquérito sociolinguístico no Belize. Em 1972, foi nomeado professor de Sociologia na mesma universidade. Regressou a Estrasburgo em 1974 e tornou-se Diretor do GERSULP em 1976. Defendeu a sua tese de doutoramento em 1984. Título da tese: Ecriture, monnaie et connaissance (Escrita, moeda e conhecimento).

De 1982 a 1990, juntamente com Michel Paty, foi co-editor-chefe da revista bilingue Fundamenta Scientiae, publicada pela Pergamon em Oxford.  É membro fundador da rede internacional PCST (Public Communication of Science and Technology).

É o tradutor das principais obras do filósofo Paul Feyerabend para as Editions du Seuil. Desde 2005, tem estado envolvido na conceção e gestão do Liceu Ermesinde em Mersch (Luxemburgo). Desde 2014, é também membro associado do Centro de Filosofia da Ciência da Universidade de Lisboa.